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O tratamento pode ser medicamentoso, usando analgésico, anti-inflamatório não esteroide, e, nos casos de ativação intensa da doença, o uso de imunossupressores que agem no sistema imune, diminuindo a ativação da mesma. Em alguns casos se realiza cirurgias para reposicionamento das articulações dos joelhos e do quadril.
A fisioterapia é um dos tratamentos mais importantes para alívio das dores, correção postural, melhora da mobilidade e exercícios corretos que auxiliam muito na diminuição da atividade da doença e diminuição das dores. Terapias como a psicologia são importantes devido à dificuldade da aceitação da doença, uma vez que a anquilose não é tão perceptível a olhos alheios, e muitas vezes as pessoas não enxergam como doença, interpretando erroneamente o doente. A psicologia é importante neste caso, pois a dificuldade de mobilidade nos estágios avançados mexe muito com o emocional das pessoas. A acupuntura, embora não haja estudos científicos que comprovem a sua eficácia, tem trazido bons resultados, diminuindo as dores e aumentando o equilíbrio do sistema imunológico, além de diminuir a ansiedade e trabalhar bem com o emocional dos pacientes.
Existe também a terapia biológica, que é recente e consiste em injeções subcutâneas ou intravenosas de medicamentos que combatem a dor, a inflamação e as alterações imunológicas, por serem à base de anticorpos monoclonais, proteínas de fusão celular, anti-interleucinas e bloqueadores da coestimulação do linfócito T.
